בעונה הבאה, לוטון טאון תיכנס לליגת העל האנגלית, פרמייר ליג, לראשונה בתולדותיה, לאחר שניצחה את קובנטרי סיטי 6-5 בפנדלים לאחר סיום המשחק המקורי והארכה 1-1 בפלייאוף המוקדמות. גמר לשלב השני באליפות, שבת, באצטדיון וומבלי בלונדון.

לוטון שיחקה את עונתה האחרונה בליגת האורות בשנים 1991-1992, שהייתה האחרונה לפני שהליגה עברה לשיטתה החדשה תחת השם "פרמייר ליג".

לוטון הצטרף לברנלי ושפילד יונייטד לפרמיירליג.

לוטון סיימה את ה"אליפות" במקום השלישי אחרי המוקדמות הישירות ועברה את חצי הגמר במוקדמות ה"פלייאוף", שם גברה על סנדרלנד 3-2 במצטבר (2-1 ו-2-0).

בגמר באצטדיון וומבלי בשבת הוא התקדם דרך ג'ורדן קלארק (23), בעוד גוסטבו האמר ההולנדי השווה לקובנטרי (66), ושתי הקבוצות פנו להארכה ולאחר מכן פנדלים.

לוטון הפך למועדון הראשון בעידן "הפרמיירליג" שעלה מהרמה החמישית בפירמידה של הכדורגל האנגלי לליגת העל.